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복잡한 단백질 구조 분석, 이제 클릭 한 번이면 해결 twitter   facebook  
이름 : 언론홍보 | 작성일 : 2020.07.20 09:33 | 조회수 : 809

복잡한 단백질 구조 분석, 이제 클릭 한 번이면 해결


당단백질 분류 자동화 알고리즘으로 구조 연구·신약 품질관리 효율성 제고



 한국기초과학지원연구원(원장 신형식, 이하 KBSI) 바이오융합연구부 유종신·김진영 박사 연구팀(이하 연구팀)이 단백질에 결합된 당의 구조와 위치에 따라 당단백질을 자동으로 분류하는 분석 시스템을 개발함에 따라 바이러스 백신개발, 복제의약품 개발속도 등을 획기적으로 줄일 수 있게 됐다.


 연구팀이 개발한 당단백질 자동 분석 시스템의 핵심은 질량분석기에서 얻어지는 질량분석 스펙트럼을 빠르게 분석해내는 자체 알고리즘이다. 이를 구현한 소프트웨어가 단백질에 결합된 당의 구조와 위치에 따라 당단백질을 빠르고 정확하게 분류한다. 특히, 암발병과 연관성이 밝혀졌으나, 그동안 분석이 어려웠던 ‘뮤신’타입의 당단백질 분류도 세계 최초로 가능하다.


▲ 당단백질 질량분석 스펙트럼 분석을 통한 뮤신타입 당단백질의 분류


 당단백질은 단백질을 구성하는 아미노산의 특정 부위에 당이 결합된 것으로, 바이오의약품의 주요 성분, 신약 개발을 위한 표적단백질, 질환을 조기에 진단하는 바이오마커 등 활용의 폭이 매우 넓다. 특히, 코로나19 바이러스 표면의 주요 물질인 ‘스파이크 단백질’도 당단백질의 일종으로서 바이러스의 세포 침투과정과 변이 여부에 대한 연구에도 당단백질 구조를 분석하는 것이 중요한 역할을 한다.


 이러한 당단백질의 분석에는 주로 질량분석기가 활용되는데, 실험 결과인 분석 스펙트럼이 복잡하여 단백질에 결합된 당의 종류나 결합 위치를 정확하게 파악하기 위해서는 연구자가 일일이 직접 분석하고 분류해야해, 분석과정이 까다롭고 시간도 매우 많이 필요하다는 단점이 있었다.


 이번에 연구팀이 개발한 시스템은 분석과정을 자동화함으로써 시간을 획기적으로 단축시키면서도 높은 정확도를 유지한다는데 큰 의의가 있다. 기존 분류방식으로는 1개월 이상이 소요되는 분석이 자동화 시스템을 이용하면 24시간 이내에 결과를 얻을 수 있다.


▲ 바이오의약품(당단백질) 분석 사례


 이번 연구는 분석화학분야 국제학술지 Analytical Chemistry誌 (논문명 : Classification of Mucin-Type O-Glycopeptides Using Higher-Energy Collisional Dissociation in Mass Spectrometry)를 통해 지난 7월 10일 소개되었다.


 제1저자로는 KBSI 소속 박사후연구원인 박건욱 박사와 이지원 충남대 분석과학기술대학원(GRAST) 석사과정생이 참여했다.


 공동 교신저자인 KBSI 유종신 박사는 “이번 연구결과를 통해 정량적․정성적 측면 모두에서 당단백질의 구조를 보다 빠르고 정확하게 분석할 수 있는 길이 열려 향후 백신, 재조합단백질, 바이오시밀러 등 다양한 바이오 의약품의 구조를 검증하고, 엄격한 품질관리 전략을 세우는 데 도움이 될 수 있을 것”이라고 밝혔다.


 공동 교신저자이자 해당 분야 연구를 총괄하는 KBSI 김진영 바이오융합연구부장은 “이번 연구성과는 특히 세계 최초로 뮤신타입의 당단백질을 높은 정확도로 자동 분석할 수 있게 된데 그 의미가 크다”며, “이번에 개발된 시스템과 KBSI가 보유한 첨단 분석연구장비들을 연계하여, 의학적·학술적으로 중요한 여러 당단백질의 구조를 규명하는 후속연구를 이어갈 것”이라고 밝혔다.


 이번 연구는 국가과학기술연구회 창의형 융합연구사업과 KBSI의 기관고유사업 및 한국연구재단의 연구장비엔지니어링 사업의 지원을 받아 이뤄졌다.  <끝>

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